ואנס חובר לגיבס וחוזר לשטח כדי לפתור תעלומת רצח הקשורה בסוכן לשעבר באן-סי-איי-אס, שוואנס שלח בעבר לכלא בעוון גניבת ראיות.

הסוכן דורנגט ממבצעי סייבר עוזר לצוות לאחר שקצינה צעירה שעבדה ביחידת הסייבר של המשרד למודיעין ימי נמצאה מתה. בנוסף, חברי הצוות מגלים שג'ייק וגיבס הפכו לחברים טובים.

חובשת לשעבר מהצי מטפלת בפצועים בתאונת פגע וברח, המשטרה עוצרת אותה מפני שהגישה טיפול רפואי ללא רישיון וגיבס והצוות מתגייסים כדי למצוא את הנהג שגרם לתאונה ולהציל את החובשת ממאסר.

גיבס והצוות יוצאים לחקור מקרה רצח לו היה עד צלם צבאי שנעלם לפני מתן עדות במשפט. בינתיים, אבי מנסה לעזור לחסרת בית צעירה ליצור קשר עם משפחתה.

רצח של איש אבטחה בנמל חושף את מיקומו האפשרי של פרסה והצוות ממשיך בחיפוש חסר הפשרות אחריו, בינתיים בישופ מתוודה על יחסיה בעבר עם הטרוריסט החמקמק.

לאחר שמתגלה שמישהו צותת למזכירת הצי במהלך תדרוך חשאי, האנליסטית מהסוכנות לביטחון לאומי, אלי בישופ, שחזתה את התרחיש בדו"ח שכתבה שנתיים לפני כן, מצטרפת לחקירה של צוות אן-סי-איי-אס.

צוות אן-סי-איי-אס נעזר בטוויטר כדי למצוא קצין צי שנעלם. בו בזמן, מקגי מאבד את התג ותעודת הזהות שלו אבל מסתיר את המידע מגיבס ומהרשויות.

טבח ממשחתת הצי מגלה שעוקבים אחריו אך אינו יודע מדוע. צוות אן-סי-איי-אס נחקר על ידי נציג מהמחלקה לבטחון בנוגע לתגובתם למקרה בודנר.

תאונת דרכים שגבתה שני קורבנות מעוררת באבי פלאשבקים של מקרה דומה בילדותה.

הצוות חוקר מקרה רצח של עיתונאי. זיוה מופתעת מביקור של אביה שאותו לא ראתה כשנתיים. על אף טענתו כי הביקור ידידותי, הביקור הסודי מתגלה על ידי אויבים ומוביל לתקרית ירי.

צוות אן-סי-איי-אס חוקר נסיבות של רצח מסתורי של עובד אן-סי-איי-אס שנמצא מספר שבועות לאחר פיצוץ הבניין. בינתיים, חברי הצוות צריכים לעבור הערכה פסיכיאטרית, והדבר גורם לגיבס לדאוג לאבי.

לאחר ההצתה על הספינה, חקירתו של הצוות מגלה כי מדובר באותו מצית סדרתי בו נתקלו בעבר.

ד"ר רוברט בנקס, פסיכולוג של הצי, נמצא מת. נדמה שמדובר בהתאבדות אך הצוות פותח בחקירה.

כשקפטן בחיל הים נרצח בבית מלון, הצוות חוקר ומגיע ליעד האמיתי של הרוצחים, אישה בהיריון שמשרתת בחיל הנחתים ואשר התינוק שלה הוא היורש היחיד של אדמה במיקום אסטרטגי.

חברי הצוות חייבים להגן על מפקד בצי כשהם מגלים שמישהו מנסה להרוג אותו.

בפרק סיום העונה, חברי הצוות עלו על זהותו של הרוצח הסדרתי, שמכין להם מלכודת אחרונה משלו.

נסיון התנקשות כושל בשר ההגנה של בלגראביה מאלץ את חברי הצוות לשמור באופן הדוק על בתו.

הצוות מופקד על שמירתו של אלי דוד – ראש המוסד ואביה של זיוה, במהלך ועידה של היחידה.

בפתיחת העונה השמינית, לאחר העימות של גיבס עם פאלומה ריינוסה, הוא מוסתר בשמירה הגנתית בבית של בנו.

בפרק האחרון לעונה, גיבס נחטף בידי מנהיגת קרטל הסמים ריונסה כנקמה על הריגת אביה והעסק הולך ומסתבך.

חברי הצוות נדהמים לגלות שגופה שנמצאה על החוף היא של הסוכנת לארה מייסי – חברת צוות לשעבר וחברה קרובה של גיבס.

כאשר חייל מאירנס נמצא מת, גיבס והצוות יוצאים לכביש הפתוח לעצור פעילות משאיות לא חוקית.

שני פקחי יערות מוצאים גופה לאחר שריפה ביער. הצוות מגלה כי מדובר בגופת טייס שהתרסק.

בפתיחת העונה השביעית, מספר חודשים חלפו מאז שגיבס השאיר את זיוה בישראל, ואיש מחברי הצוות לא שמע ממנה מאז.

הסוכן ריבקין מת מפצעיו בבית החולים חרף נסיונותיה של זיוה לעזור לו, בעוד דירתה של זיוה נהרסת בהתפוצצות. חברי הצוות נוסעים לישראל בהזמנתו של ראש המוסד, אלי דוד.

אקדח נמצא בין חפצי בנו בן ה-12 של קצין בחיל הנחתים. גיבס והצוות נקראים לחקור מאיפה הגיע הנשק.

בעוד חברי הצוות חוקרים את מותו של קצין במארינס, הם מוצאים את תעודת המארין של גיבס בזירת הפשע.

זיוה מתוסכלת כשהיא לא מצליחה להשיג כרטיס טיסה לישראל. הצוות נקרא לחקור את המקרה של אדם שנדקר למוות במוסך שלו.

כששני רוכבי אופניים מוצאים גופה בנהר, הצוות פותח בחקירה ומגלה כי הקורבן הוא קצין בכיר שניהל רומן עם הסנטור פטריק קיילי, ששירת בעבר בחיל הנחתים לצד גיבס.

פאלמר מזהה רוצח מסתורי כאדם מעברו, ונהיה המטרה המרכזית שלו.

הצוות נקרא לעזרה כאשר קצין בחיל הים מאיים לקפוץ מגג בניין. ניסיון ההתאבדות הופך במהרה לחקירת רצח.

גיבס ומאן משתפים פעולה בחקירה אודות מפקד במארינס שהייתה לו גישה למידע מסווג. החקירה מסתבכת כאשר מסתבר שאחת העדות היא אשתו לשעבר של האיש.

פרק 24 ואחרון לעונה. גיבס מנסה לפענח למה הסוכנים מתבקשים לעבור בדיקת פוליגרף, בעוד טוני וחברה שלו מוחזקים כבני ערובה בידי סוחר סמים.

מקגי בהלם כאשר הוא מגלה שקצין שעליו ביסס את ספרו נרצח. לצוות אין יותר מדי כיוונים לחקירה, ומקגי צריך למצוא את כל מי שהייתה לו גישה לכתביו הסודיים.

גופתו של מלח נמצאת במסעדה נטושה, והסוכנים עובדים עם שוטרים מקומיים. אחד מהם דומה מאוד לטוני באישיותיו, וטוני נפתח בפניו ומתוודה על רגשותיו כלפי ג'ן.

חברי הצוות נאלצים להשתתף בסמינר על הטרדה מינית, במהלכו נודע להם על מפקדת בחיל הים שנמצאה מתה. מתברר שהיא נחנקה מפחמן דו-חמצני, בתוך הרכב הרובוטי שהיא עזרה לפתח.

גופה חרוכה וחנוטה כמומיה נמצאת בבסיס מארינס, והצוות נקרא לחקור. התפתחות החקירה מובילה לכך שהצוות צריך לעבוד עם האף.בי.איי. בינתיים, הסוכנים כועסים על מקגי שכתב רומן ובו דמויות המזכירות אותם.

הצוות חוקר פיצוץ שהתרחש בקאנטרי קלאב של הצבא והרג קולונל במארינס, ועובד יחד עם יחידת חקירה צבאית. בינתיים, טוני שומר על אהבתו החדשה בסוד מהצוות.

גיבס חוזר זמנית לצוות כסוכן, כאשר אסיר שהוא ופורנל שלחו לכלא בורח והופך לאיום עבור פורנל ובתו הקטנה.