למייקל מוצעת עסקה מאוייב מהעבר אך הוא לא יודע אם לבטוח בו. שרה מטפלת בלינק הגוסס אך נתקלת בהפרעה, וגם, נגלה מה קורה לחבורה אחרי 4 שנים…

לינק, טי-באג, סלף וגרטשן נוסעים למיאמי בעקבות סילה. לאחר "עסקת החליפין" שעושה לינק עם הגנרל, מייקל מוצא את עצמו בבקתה מבודדת ביער עם פסיכיאטר הטוען שאמו חיה, ומנסה לשכנע אותו…

מייקל מסרב ללכת לניתוח ונכנס עם כל החבורה להוציא את "סילה". טי-באג וגרטשן טומנים לטרישן ולסלף מלכודת מתוך כוונה לקחת את "סילה" מהחבורה ברגע שיוציאו אותה בלי הפרעות מיותרות.

עונה רביעית לדרמת המתח. אחרי שהנדסו בריחה מהכלא הסיוטי "סונה" בפנמה, האחים מייקל סקופילד ולינקולן בורוז נחושים לנקום בארגון הצללים "החברה", הארגון שאחראי להרס חייהם.

בפרק סיום העונה, מייקל ולינק תופסים את ויסלר ומשנים את מקום הפגישה עם סוזן. הסוהרים מענים את סוכרה ומנסים להוציא ממנו מידע בנוגע למיקומו של מייקל. טי-באג מנסה לנצל את…

הבריחה מסונה יוצאת לדרך. מייקל נותן לטי-באג, לוצ'רו ובליק לברוח ראשונים ונראה שתוכנית הבריחה של מייקל לא תצא לפועל. לוצ'רו חוטף כדור בעוד ניסיון בריחה שאי אפשר לדעת מה עומד…

יום הבריחה מגיע. מייקל מאיים על ביטול כל עניין הבריחה בתנאי שהוא יראה הוכחה חדה ומוכחת ששרה עדיין חיה. טיג, שעקב אחרי ויסלר, נרצח, והחשד נופל על ויסלר ולמאהון יש…

עונה שלישית, כלא חדש, צרות ישנות. סקופילד מצא את עצמו שוב בכלא, הפעם בכלא סונה שבפנמה, בלי תכנית בריחה וללא לינק שקיבל חנינה נשיאותית. האם יכול להיות שהוא שפן ניסיונות…

סוכרה יוצא מביה"ח כדי לחפש את מריקרוז, פוגש את בליק ומנסה להוציא ממנו מידע. מייקל נותן למהון את האנייה. כשקים מגיע למחסן שבו כלא מהון את מייקל ואת לינק מתפתח…

מייקל ולינק מגיעים עם קלרמן לבית של סטדמן וקלרמן מסביר שסטדמן נעדר כל סימני זיהוי. טי-באג הופך את סוזן וילדיה לבני ערובה. אשתו של סי-נוט, נשפטת על סיוע לפושע. בראד…

מייקל חוקר אודות מהון ומגלה את סודותיו. סי-נוט מנסה להתאחד עם משפחתו כשהאף.בי.איי. בעקבותיו. טי-באג מבקש לנקום ב-"אהובתו" ומנסה להגיע אליה.

העונה השניה עוקבת אחרי מסעם של חבורת העבריינים הבורחים מפני החוק. שמונת האסירים הנמלטים מתמודדים עם מרדף חסר תקדים בהיקפו. כל אחד מהם מנסה למצוא מחסה מהמשטרה ולהתחיל בחיים חדשים.

פרק סיום העונה. הבריחה מחוץ לכלא, מתחילה. פופ מארגן צוות שדולק בעקבות הבורחים. הפתעה בלתי צפוייה מאיימת על שלמות החבורה. "החברה" מנסה לאלץ את סגנית הנשיא לפרוש מהמירוץ לנשיאות, תוך…

השופט מקבל חומר אנונימי שמטיל ספק בכך שהגופה בקבר היא של סטדמן. מייקל מתכנן בריחה במסלול אחר, דרך אגף חולי הנפש. לינקולן משוכנע שראה את אביו האובד בתא הצפייה בהוצאה…

הבריחה נכשלת. ההוצאה להורג בעוד 24 שעות. מייקל מבין שתקלה בכיסא החשמלי תביא לדחייה ומחליט לנסות לחבל בו. מייקל מבקש משרה שתדבר עם אביה, כדי שיבחן את המקרה של לינקולן….