לאחר הארועים המטלטלים בעונה הקודמת, מרדית אוספת את השברים וממשיכה הלאה בחייה, כשהעתיד נראה ורוד יותר. ביילי נלחמת על תפקיד הצ'יף, וקאלי חוזרת אל עולם הדייטים למורת רוחה של אריזונה.

אמיליה נפתחת בפני מרדית, ומספרת לה על חוויותיה בסיאטל. בינתיים, קאלי מקבלת חדשות לא טובות, ביילי נושאת בתוצאות המעשים שלה, והמתמחים המומים לגלות כי אחד מהם עומד למצוא את עצמו…

ד"ר פרסטון ברק מגיע לסיאטל למפגש פסגה עם כריסטינה יאנג. כריסטינה מתייעצת עם מרדית לגבי העתיד שלה, דרק ואמיליה מאחדים כוחות כדי לטפל בתאומים סיאמיים, וסטפני חושפת את האמת במקרה…

מגי מנסה להוכיח את שוויה ולהתיידד עם אחרים בבית החולים, אבל הדבר קשה משחשבה. בינתיים, ריצ'רד מנסה להסתיר את סודו, והרופאים מסייעים לאישה גוססת שבתה לא מוכנה להרפות ממנה.

בפתיחת העונה, מרדית מנסה לאסוף את השברים לאחר עזיבתה של כריסטינה ומתמודדת עם דרק שלא מוכן לוותר על החלום שלו. המניות של כריסטינה עוברות לאלכס שיכול לזכות בכיסא הנהלה, על…

הרופאים מקבלים חדשות לא טובות מג'קסון. בינתיים, אמיליה מגיעה לסיאטל לביקור בלתי צפוי, ריצ'רד נוסע לבוסטון להפתיע את קתרין, וביילי מקבלת החלטה נועזת בגלל חוסר ההתקדמות במחקר שלה.

הלחץ על דרק הולך וגובר, גם בבית וגם בעבודה. בינתיים, מרדית עוזרת לכריסטינה לכתוב נאום זכייה במידה ותזכה בפרס לו היא מועמדת. אפריל וג'קסון חווים בעיות בחיי הנישואים, וקאלי ואריזונה…

כריסטינה מועמדת לפרס יוקרתי ולמרות שכולם מתרגשים סביבה, היא מצליחה לשמור על קור רוח. בינתיים, ביילי מנסה לעזור לילד שאין לו מערכת חיסונית, ודרק וקאלי משתמשים במכונה שמזהה את הרגשות.

מגפת שפעת מציפה את בית החולים, וכולם חולים. דרק צריך לספק נאום חשוב על מיפוי המוח, למרות שהוא חש ברע. רופא חדש מציג לאלכס שיטות חדשות לעסוק ברפואה.

כריסטינה ניצבת בפני החלטה גורלית שעליה לקבל, ומדמיינת שני תסריטים בהם יכולים להשתנות חייה. בינתיים, לבית החולים מגיע חולה שצריך לבחור האם לחיות או למות.

מרדית מקבלת אסיסטנט לפרויקט הוריד שלה. בינתיים, ריצ'רד מקבל מתנת יום הולדת מיוחדת מביילי כשהיא מאפשרת לו להשתתף בניתוח יוצא דופן. קאלי מפתיע את דרק, וצעירה בהריון מבקשת עזרה משיין.

דרק אינו מקיים את ההבטחה שלו לקאלי, ואחד מהרופאים מושעה בעקבות מדיניות הזוגיות החדשה. בינתיים, תינוק ננטש בבית החולים, וחולה שניצב בפני כריתת שתי רגליו מקבל ייעוץ מאריזונה.

תלונה שמתקבלת בבית החולים מובילה ליישום מדיניות חדשה, שגורמת לזוגות בצוות לחשוש. בינתיים, אמה ואוון דנים בעתידם, וריצארד מנסה לרתום את הרופאים הבכירים למחקר על סרטן.

לאחר הכרזת האהבה המפתיעה של ג'קסון, אפריל צריכה לקבל החלטה קשה. דרק לא מקיים את הבטחתו למרדית והיא מרגישה נבגדת, קאלי ואריזונה מגיעות להחלטות בנוגע למערכת היחסים שלהן, וביילי מגלה…

סופה עוצמתית מכה בסיאטל וצוות הרופאים בבית החולים נזרק אל תוך תוהו ובוהו. האמצעים להתמודד עם עשרות הפצועים הזורמים פנימה הופכים דלים מרגע לרגע והמצב הופך מורכב עוד יותר כשאחד…

ביום חתונתה של אפריל כולם עסוקים בעצמם, מרדית וכריסטינה מתווכחות על המחקר שלהן, ביילי מתוודה בפני בן על רגשותיה לגבי חזרתו לסיאטל ודרק מקבל שיחת טלפון המשנה את חייו.

אחיותיה של אפריל מגיעות לסיאטל כדי לעזור בחגיגות החתונה ובמהרה מצליחות להוציא אותה מהכלים. מתיו וגקסון נאלצים לעבוד יחד לאחר שהיו עדים לתאונה קשה, וקאלי ואריזונה מתחילות לשקם את מערכת…

סיטואציה מסכנת חיים מרחפת מעל הרופאים בעוד הם נלחמים להציל את חיי חבריהם. ביילי ובן מקבלים החלטה בנוגע למערכת היחסים ביניהם. ריצ'רד מתכנן ארוחת ערב מיוחדת לרופאים וטדי מקבלת הצעה…

הרופאים מתכוננים מבעוד מועד לסופה קיצונית העתידה להכות בסיאטל. חלומו של אוון להפוך להורה מתעצם כשהוא מתקרב לאית'ן.

הרופאים מנסים לסייע לביילי אך היא אינה מאפשרת להם להתקרב אליה. לאחר תקרית עם סבתו של אית'ן, אוון חושש כי הילד ימצא עצמו מועבר לשירותי הרווחה. סייעת של קוסם מגיעה…

המתמחים מקבלים החלטות משמעותיות לגבי הקריירה שלהם כשהם בוחרים היכן לעבוד אחרי תקופת ההתמחות. מארק מתוודה בפני דרק על הדילמה הגדולה בבחירה בין ג'וליה לבין לקסי.

המתיחות בין כריסטינה למרדית גוברת וכריסטינה מתנחמת אצל שיין. בן מודאג שיחסיו עם ביילי יתערערו בעקבות שיחתו עם דרק. ההכנות לחתונה של אפריל גורמות למבוכה בין גקסון לסטפני.

לאחר מותם של מספר פציינטים שלה, ביילי מוצאת עצמה במרכז החקירה של המרכז לבקרת מחלות ומניעתן. בינתיים, ג'קסון ושאר חברי הדירקטוריון מנסים להחליט כיצד לפרסם את המידע בנושא הנ"ל לציבור…

לאחר חדשות מרעישות שמגיעות לאוזניהם, מחליטים מרדית' ודרק לעשות מספר צעדי מנע בנוגע לעתיד ילדם. קבוצה של רופאים סורים מגיעים לבית החולים לקבלת שיעור מהיר הצעדים הבסיסיים בכירורגיה.

תביעת רשלנות רפואית המאיימת על עתידה המקצועי של קאלי, חושפת פרטים חדשים ומפתיעים על חיי הנישואין שלה ושל אריזונה בסדרה של פלאשבקים מהעבר. אביה של קאלי מגיע לתמוך בה ומנסה…

המתמחים נזכרים מחדש בכל תשובה שענו במבחניהם ומתענים סביב היכולות שהציגו. הרופאים נאלצים לטפל בחולה ששליש מגולגולתו חסר והוא נמצא במצב קשה מאוד.

לאחר שמונה שנים בתרגול מעשי, המתמחים יוצאים לסן פרנסיסקו כדי לעבור מבחנים בעל פה. כשקת'רין וריצ'רד נפגשים במקרה בבית המלון, העניינים מתחממים בין השניים.

המתיחותת בין מרדית לכריסטינה מחריפה ומובילה לבגידה. דרק מיעץ לג'קסון להתחיל ללמד ולתת למתמחים לבדוק את המטופלים שלו. אפריל ומתיו מגיעים להחלטה חשובה, ובן חושש שמשהו לא בסדר אצל ביילי.

משאית גז מתפוצצת על כביש ראשי בסיאטל, דבר המוביל לפצועים רבים, בכללם גם מת'יו הפראמדיק. מרדית' וג'ו מנסות לסייע לאם אבודה שבנה סובל ממחלה מסתורית.

צוות הרופאים מטפל באישה אנונימית, שמסתבר כי היא מעורבת בפרשייה אשר כל המדינה עוקבת אחריה. לריצ'רד צפויה התפכחות לא נעימה בעת ביקורו אצל אדל.

מטופלים מפחידים מגיעים לבית החולים בליל כל הקדושים, ומשבשים את התכניות של הרופאים. דרק ובן עובדים יחד בהליך ניתוחי חדש, וריצ'רד מרגיז את ביילי כאשר הוא מבקש שמתמחה שנה ב'…

בעוד בית החולים ממשיך במגמת השיפור תחת ההנהלה החדשה, הרופאים מתחילים להבין כי הבעלות על בית החולים, מגיעה עם ערב רב של סוגיות חדשות שיש לפתור אותן. מרדית' מודאגת מאוד…

פגועה קשות, כריסטינה דורשת מאוון לחשוף בפניה את כל פרטי הרומן אותו ניהל. מארק לוקח את האחריות החדשה אותה קיבל ברצינות מרובה כאשר הוא מתעמת בצורה חריפה עם ריצ'רד סביב…

אריה שברח ומסתובב חופשי בסיאטל מסכן את חייהם ואת מערכת היחסים של זוג צעיר. טדי מתחילה לעשות צעדים לקראת השלמה עם מותו של הנרי. היחסים בין כריסטינה ואוון מגיעים לנקודת…

דרק וקאלי משתפים פעולה בפרויקט מסובך, בעוד מרדית' שוקלת להמשיך את מחקרה של אמה. ריצ'רד מציע שמצבו הפיזי יהווה כלי למידה. שיין מתמלא רגשות אשמה לגבי מותה של הת'ר.

המצב הכאוטי בו עומד בית החולים תחת ההנהלה החדשה מוביל את אחד הרופאים לפקפק בעתידו במוסד. בינתיים, צוות הרופאים מלהטט בין מספר ניתוחי השתלה מורכבים, כשלכל מקרה, הסיבוכים משלו.

מרדית' מתקשה לאזן בין העבודה להורות. סטפני שואפת להרשים את אמו של ג'קסון. ג'ו מתחברת יותר מדי למטופל, וקאלי ואוון נקלעים לדילמה אמוציונלית סביב מטופלת שלהם.

בעוד השמועה על הצרות הכלכליות של בית החולים נפוצה, המתמחים החדשים חוששים כי הם עלולים לאבד את משרתם.

דרק מבקש ממרדית' לחזור ולעבוד איתו במחלקה הנוירולוגית. אמו של אייברי חוזרת ל-"סיאטל גרייס" ומגלה עניין מיוחד בריצ'רד. כריסטינה ממשיכה לחשוד באוון…

בעוד בית החולים מתפורר מבחינה כלכלית, אוון נאלץ לקבל החלטות קשות, כולל ויתור על ניתוח מורכב שייתכן ויציל את חייו של ילד צעיר. אלכס וג'ו עובדים יחדיו על מנת להציל…