נחשפת זהותו של האיום שעלול להרוס את ציר הזמן, וכעת הצורך להגן עליו בכל מחיר גורם לכל סוכן לפקפק בערכים שלו.

העונה השביעית והאחרונה תתמודד עם מסעות בזמן, תחזיר למסך כמה דמויות אהובות ותסגור קצוות עלילה שנותרו מהסרטים, מעונות קודמות וגם מסדרת הבת.

ד"ר רדקליף רודף אחרי משפחת קניג, על מנת להשיג את הדארק הולד. העליון, מספר לרדקליף על התוכנית שלו. ובינתיים, פיץ וסימונס מנסים לפצח את הקוד של רובו-רדקליף.

סקיי לא מסוגלת להחליט האם לחבור לש.י.ל.ד או לבלתי אנושיים, בעוד שתי הקבוצות הולכות ומתרחקות אחת מהשנייה. בינתיים, הסוכן קולסון מתוודה על סוד שלא סיפר עליו לאף אחד.

פיץ-סימונס וטריפ יורדים למנהרות כדי לטמון פצצות ליד המקדש והם לא יודעים באיזה מצב הם יתקלו שם במאק. בינתיים, סקיי נפגשת עם אביה והוא מגלה לה עובדות מפתיעות על עברה.

הצוות מנצח את "הידרה" במירוץ לאיתור העיר העתיקה, אולם צריך לשלם כדי לחשוף את סודותיה של העיר. בינתיים, מיי וסקיי ממהרות למצוא את ריינה לפני שוויטהול יגיע אליה.

עונה שנייה לסדרת האקשן המדוברת. בהמשך לסיום העונה הקודמת, גרנט וורד נמצא במעצר לאחר שנחשף כי היה סוכן כפול של הידרה, מלינדה מיי ממשיכה לעקוב אחרי קולסון, ניק פיורי נעלם,…

פרק 22 ואחרון לעונה. סודות אפלים נחשפים כאשר קולסון והצוות מסכנים הכל כדי לעצור את גארט ואת הידרה. בתפקיד אורח: סמואל ל' ג'קסון.

כאשר עולמם מתהפך לחלוטין, קולסון מזדרז להציל את חייה של אהבתו הגדולה מכולן.

קולסון והצוות מחפשים מקלט מהקולונל גלן טלבוט – במקום האחרון שמישהו יחשוב עליו. הם מתחילים לחשוף את סודותיה המסוכנים ביותר של סוכנות ש.י.ל.ד, סודות העלולים להשמיד את כולם.