עונה רביעית לדרמת המתח. אחרי שהנדסו בריחה מהכלא הסיוטי "סונה" בפנמה, האחים מייקל סקופילד ולינקולן בורוז נחושים לנקום בארגון הצללים "החברה", הארגון שאחראי להרס חייהם.
סוכרה יוצא מביה"ח כדי לחפש את מריקרוז, פוגש את בליק ומנסה להוציא ממנו מידע. מייקל נותן למהון את האנייה. כשקים מגיע למחסן שבו כלא מהון את מייקל ואת לינק מתפתח…
מייקל ולינק מגיעים עם קלרמן לבית של סטדמן וקלרמן מסביר שסטדמן נעדר כל סימני זיהוי. טי-באג הופך את סוזן וילדיה לבני ערובה. אשתו של סי-נוט, נשפטת על סיוע לפושע. בראד…
לינקולן עושה דרכו לפגישה עם מייקל. קלרמן מענה את שרה בנסיון לקבל תשובות לשאלותיו. קים משחרר את מהון שנכלא ע"י מייקל, ומאיים עליו. מייקל נתקל בקשיים באירגון הטיסה לפנמה.
