שון מתקשה להתמודד עם הלחץ והגירויים באזור ההסגר. מורגן נאלצת להתאמץ כדי לדאוג שהמטופלים שלה ישרדו. קלייר ומלנדז מחפשים דרך לבצע השתלת מח עצם למרות ההסגר.

שון, מורגן ולים נמצאים בהסגר בחדר מיון בעקבות התפרצות של נגיף דמוי-סארס. מלנדז וקלייר מטפלים באדם שזקוק להשתלת עצם, והתורם שלו נמצא גם הוא באזור ההסגר.

מייקל מוצא את ויסלר, אבל מתברר שיש פרס על ראשו, וכשמהון מגלה שהוא נמצא בביוב הוא מחליט למצוא אותו ולהסגיר אותו, תמורת שחרורו האפשרי. לינק עוקב אחרי חברתו של ויסלר.

טי-באג מאבד את המיליונים בשדה התעופה במקסיקו. מייקל מצליח להעביר פתק לנשיאה. בליק מוצא את סוכרה וזה מציע לו עסקה. הנשיאה מודיעה הודעה דרמטית.

מהון שולח את בליק למקסיקו לתפוס את סוכרה. מייקל ולינקולן יוצרים קשר עם קופר גרין, איש "החברה" ששהם אמורים לתת לו את הקלטת שמנקה את לינקולן מאשמה. קים מודיע למהון…

מייקל ושרה כמעט נתפסים במועדון הסיגרים אך מגלים שהנרי פופ, חבר במועדון. טי-באג נוסע עם סוזן ועם ילדיה לאלבמה, להקים לעצמו משפחה. בתו של סי-נוט חולה מאוד. סוכרה נפגש עם…

הייווייר מתחיל לפענח את הקעקוע של מייקל ואינו ישן, ומייקל לא יכול לחפור. ורוניקה מחליטה לייצג את לינקולן. השירות החשאי מגלה את הקשר בין מייקל ולינקולן ומחליט להעביר את מייקל…

מייקל מגיע לטריטוריה של "טי-באג" כדי לקחת בורג שהוא זקוק לו לבריחה. בין האסירים השחורים ללבנים יש עימות, ומייקל צריך לבחור לאיזה צד הוא שייך. ורוניקה מקבלת קלטת של ליל…

מייקל סקופילד נמצא במצב נואש – אחיו נידון למוות על רצח שמייקל מאמין שלא ביצע, ומייקל מבצע שוד ע"מ להיכנס לכלא ולעזור לאחיו. מתוך הכלא הוא מכין תוכנית כדי להוציא…