בפרק סיום העונה, הצוות חוקר מקרה של שריפה על ספינת קרב ששימשה גם כמתקן חקירה סודי לטרוריסטים. בינתיים, גיבס חוזר לבית ילדותו בעקבות החדשות על מותו של אביו.

המנהל ואנס שולח את דינוזו למשימה מיוחדת להחזיר הביתה בת של אדמירל מצרפת, אבל עליו להיעזר בחבריו לצוות לאחר שהוא מואשם ברצח.

גיבס והצוות יוצאים לחקור מקרה רצח לו היה עד צלם צבאי שנעלם לפני מתן עדות במשפט. בינתיים, אבי מנסה לעזור לחסרת בית צעירה ליצור קשר עם משפחתה.

לאחר שגופתו של קצין בצי מתגלה בעיירה, על חברי הצוות להכריע האם מת כתוצאה מקטטה בבר או מפני שידע יותר מדי על תקיפה מינית שעברה ידידתו. בינתיים מקגי וטוני מתנסים…

לאחר שגופתו של חבר הקונגרס דן מקליין, סוכן אן-איי-אס לשעבר, נמצאת לחוף הנהר בניו אורלינס, גיבס חובר לעמיתו לשעבר, הסוכן המיוחד דווין קסיוס פרייד, לחקירה משולבת.

דלילה, בת זוגו של מקגי, מגלה פרצה בחקירה שנויה במחלוקת לאחר שובה לתפקידה במשרד ההגנה. התגלית מובילה אותה לבקש את עזרתם של צוות סוכני אן-סי-איי-אס.

לאחר שגופתו של חבר הקונגרס דן מקליין, סוכן אן-איי-אס לשעבר, נמצאת לחוף הנהר בניו אורלינס, גיבס חובר לעמיתו לשעבר, הסוכן המיוחד דווין קסיוס פרייד, לחקירה משולבת.

לאחר שמטען מתפוצץ בחדר הלבשה לפני מופע צדקה, על הצוות להכריע האם המטרה הייתה חיסולו של כוכב רוק מזדקן או שמא מדובר במזימה רחבה יותר. בנוסף, ג'ימי מתכונן להיות אבא.

במהלך עימות בין דינוזו ואדם שהתחזה לקצין בצי, אקדחים נשלפים והמתחזה נהרג. בחקירת האירוע מתגלה שעד הראיה היחיד הוא אביו של דינוזו שהגיע לעיר כדי לגלות סוד לבנו.

לאחר גילוי אפודי מגן פגומים ברכב מלא בציוד גנוב של חיל הנחתים, צוות אן-סי-איי-אס מנסה לאתר את הגנבים ואפודים פגומים נוספים שנשלחו לחיילים מחוץ לארה"ב על ידי ארגון צדקה.

בניסיון למצוא את הטרוריסט פרסה, גיבס והצוות מאתרים את אחד משותפיו באמצעות איות מפיגוע המל"ט. בינתיים, מקגי המזועזע מתקשה להסתגל להשלכות האירוע.

רצח של איש אבטחה בנמל חושף את מיקומו האפשרי של פרסה והצוות ממשיך בחיפוש חסר הפשרות אחריו, בינתיים בישופ מתוודה על יחסיה בעבר עם הטרוריסט החמקמק.

כשמתגלה שמל"ט שנגנב קשור למחבל החמקמק פרסה, צוות אן-סי-איי-אס חובר למשרד ההגנה בתיאום עם חברתו לשעבר של גיבס, הוליס מאן, כדי לאתר את המל"ט לפני שיעשה בו שימוש בקנה מידה…

לאחר שמחלה מסתורית תוקפת ילדים של חיילים, גיבס והצוות חוקרים את המקרה. אבי וג'ימי חוברים למרכז הרפואי לחקר מחלות של הצי כדי לגלות את מקור המחלה, מתוך תקווה למצוא תרופה.

סיבוכים צצים כאשר צוות אן-סי-איי-אס מגלה קשר בין קרבן רצח והחבר הנוכחי של אשתו לשעבר של גיבס והסוכן פורנל. סוכנת הסוכנות לביטחון לאומי, האנליסטית אלי בישופ, מנסה להסתגל לעבודתה החדשה.

לאחר שמתגלה שמישהו צותת למזכירת הצי במהלך תדרוך חשאי, האנליסטית מהסוכנות לביטחון לאומי, אלי בישופ, שחזתה את התרחיש בדו"ח שכתבה שנתיים לפני כן, מצטרפת לחקירה של צוות אן-סי-איי-אס.